الاغوانا الخضراء تمتلك ثلاثة عيون، فالعين ثالثة هي عبارة عن نقطة بيضاء توجد في مقدمة رأس الاغوانا الخضراء، تسمى هذه العين "عين داخلية" وهي فقط لاستشعار الضوء والألوان ولا يوجد فيها خلايا العين العادية كالعينين الأخريين، يعتقد أن السحالي كانت تمتلك هذه العين الثالثة ولكن مع الوقت والطفرات الجينية فقدتها.