كانت إندونيسيا تعرف سابقاً باسم جزر الهند الشرقية التابعة لهولندا. وأول من أطلق عليها اسمها الحالي هو أحد الجغرافيين الألمان عام ١٨٨٤، ومن المعتقد ان اسم إندونيسيا مشتق أصلاً من كلمة "إندوس نيسوس" القديمة، ومعناها (الجزر الهندية).